Локдаун бесполезен: чем опасен омикрон-штамм COVID-19

Недавно в Шотландии и Германии произошли первые заражения.

В России новый штамм пока не фиксировали. Что такое – “Омикрон“, и чем он опасен – в подробном дайджесте наших коллег из РИА Новости

Мутации омикрон штамма

Данный вид  SARS-CoV-2 выявили 22 ноября ученые Центра инноваций и реагирования на эпидемии ЮАР вместе с частными лабораториями. Первые изученные образцы загрузили в базу GISAID. Похожий изолят нашли и в Гонконге – у мужчины, прибывшего из Южной Африки.

В геноме нового штамма – более шестидесяти мутаций.

32 из них находятся в спайк-белке. Спайк-белок, или белок-шип находится на поверхности частицы патогена. Он помогает вирусу проникнуть через мембрану клетки и начинает потом размножаться. Белок-шип провоцирует иммунный ответ организма — все существующие вакцины нацелены на него.

Это – главная часть коронавируса, за изменениями в которой и следят генетики.

SARS-CoV-2 очень легко заражает людей. Пока что надиром его эволюции считали «дельту» – у нее рекордная скорость распространения. Но и неродственному гипермутанту теперь тоже никто не удивился.

ВОЗ тут же присвоила ему идентификационный номер – B.1.1.529 и выделила в линию — «омикрон».

Эксперты уже внесли его в список вариантов, вызывающих озабоченность.  

Большая часть изменений в «омикроне» уже известна ученым. Делеция – выпадение аминокислот, в позиции 69 и 70 существует и у альфа- и эта-линий.

Несколько мутаций есть в участке, где находится код «ножниц» для разрезания белка-шипа на две цепочки пептидов. Две замены — Q498R и N501Y — осуществляют связь с мембраной клетки. А это потенциально повышает уровень заразности.

Таким образом мутации, теоретически помогающие вирусу уходить от иммунитета и повышающие скорость его размножения внутри клетки, в итоге провоцируют большую вирусную нагрузку в организме заболевшего.

Насколько омикрон-штамм распространен

Большая часть «омикрон-эпизодов» выявлена в провинции ЮАР – Гаутенг. Там он смог почти вытеснить «дельту» – на него приходится 76% всех исследованных образцов. Чиновники все же предупреждают, что в ноябре 2021 года расшифровывали слишком мало геномов, поэтому в ближайшем будущем результат поменяется.

В настоящее время в ЮАР все ждут четвертую волну COVID-19, а заболеваемость продолжает расти. 29 ноября зафиксировали уже 2273 инфицированных. 10% всех ПЦР-тестов – положительные. Пока не ясно, виновен ли в этом новый штамм.

Все больше пациентов в больницах именно с тяжелой формой. Есть и прорывные инфекции, начали госпитализировать и детей. Статистика говорит пока о 25 летальных исходов в сутки. Объясняют это тем, что смертность всегда отстает от показателей госпитализации на 2-3 недели. Также ЮАР летом пережила мощнейшую волну дельта-штамма, а значит, может срабатывать перекрестный иммунитет переболевших.

Омикрон-штамм уже существует в Гонконге, Австралии, Канаде, Израиле, некоторых странах ЕС. В подавляющем большинстве – туристы, которые вернулись из стран Южной Африки. В Голландии в пятницу зафиксировали 13 больных из 61 прилетевшего в Амстердам. О первых случаях заражения уже сообщили власти Франции, Испании и Японии.

В Саксонии – где как раз сейчас вспышка ковида –  у 39-летнего мужчины, который никогда не путешествовал и не общался с приезжими, констатировали заражение. 6 местных заражений именно «омикроном» выявили в Шотландии. Это означает, что штамм уже какое-то время свободно циркулирует внутри этих государств.

Откуда ты явился, гипермутант?

Место появления B.1.1.529 пока не установлено. Согласно действующей гипотезе, так много мутаций штамм мог получить в организме самого человека с иммунодефицитом.

Инфекция месяцами находится в организме человека, у которого ослаблен иммунитет.

В июле российские ученые сообщили о пациентке, в крови у которой возбудитель циркулировал почти 318 дней. Вирус свободно эволюционировал. Если такого пациента не изолируют, заражение от него почти неизбежно.

ЮАР является лидером по ВИЧ-инфицированным.

– Поэтому и новый вариант обнаружили именно в Южной Африке, — пояснил исполнительный директор Национального института инфекционных болезней (NICD) Адриан Рурен. – Там же год назад появилась и линия «бета».

Вакцинолог, профессор Витватерсрандского университета Шабир Мади – напротив – с выводами не спешит.

На вебинаре от издания Mail&Guardian он заострил внимание на завозном случае «омикрона» в Бельгии у туристки. Девушка вернулась из Египта, а вот на юге Африки никогда не была.

– Тот факт, что «омикрон» обнаружили в Ботсване и ЮАР, вовсе не означает, что он возник именно там, — заключил ученый.

Как находят омикрон-штамм

Все варианты ковида обнаруживают только при помощи ПЦР-тестов, которые у пациентов берут при визите к врачу. Или же – при постоянном скрининге.

Такое часто организуют для сотрудников определенных организаций или для пассажиров в аэропортах.

Коммерческие наборы диагностики для массового применения заточены под уже известные штаммы, в вот новые разновидности они могут и пропустить. Но существуют и исключения. Отдельные тест-системы выявляют три генетических маркера ковида. Если они не видят спайк-белок, это может означать, что перед нами нечто новое. Именно таким образом и «засекли» «альфу», у которой в спайк-белке существует делеция 69/70. Именно она и помогла выявить «омикрон». Для итоговых выводов необходимо секвенировать полный геном или же отдельные его участки, то есть – генотипировать.

Антигенные экспресс-тесты линию не выявляют. Они могут только показать сам факт – заражен человек или нет.

Как передается омикрон-штамм?

Ничего определенного о свойствах нового штамма ученые пока не сообщают. Они только предполагают – на основе прочих вариантов – все изменения генома.

По предварительным данным, «омикрон» очень быстро распространяется.

Если в октябре в провинции Гаутенг еще доминировала «дельта», то в ноябре ее полностью сменил новый гипермутант.

– Вот только его и находят, – сообщает генетик из США Дмитрий Прусс. – Это может значить, чисто технически, что он в 5 раз более заразен. Но так будет не везде – необходимо учитывать, что в ЮАР огромная доля уже иммунного к «дельте» населения.

Если волна COVID-19 в ЮАР так и продолжит набирать силу, то уже к концу текущей недели там будет почти десять тысяч заражений в день. А это – в несколько раз меньше, чем во время вспышки, вызванной «дельтой».

«Заболевают здоровые и молодые люди, которые общаются и часто контактируют друг с другом, особенно – студенты, – пишут местные СМИ. – Есть прорывные инфекции даже у вакцинированных. Каких-то необычных симптомов нет, все болеют в легкой форме, но в больницу попадают даже дети».

На ключевые вопросы: опасен ли штамм, насколько он заразен и может ли ускользать от вакцин, мы получим ответ только через две-три недели.

Спасет ли вакцина от нового варианта

Так как у «омикрона» есть сходство с известными штаммами, вакцины, конечно же, будут работать – следует из данных сайта NICD.

В ЮАР уже успешно применяют препараты Pfizer и Janssen. Последний — является по сути, первым компонентом «Спутника V». Пока нет никаких оснований полагать, что данная вакцина – менее эффективна. Но выждать недели 3-4 просто необходимо – для более точного ответа.

– Главная цель иммунизации — уменьшить риск тяжелой формы COVID-19 и смерти, – уверен вакцинолог Мади.

Он добавил, что, в первую очередь, нужно безотлагательно сделать прививку тем, кто еще ее не сделал, а всем остальным – ревакцинироваться.

– Это особенно важно для людей из групп риска – пожилых и работников системы здравоохранения, – пояснил он. – Ведь врачи каждый день контактируют с тяжелыми больными. Сначала лучше всего пройти полный курс – получить обе дозы. Для ревакцинации подойдет любой препарат.

В Центре Гамалеи уверены – «Спутник V» и «Спутник Лайт» защитят от омикрон-штамма. А если понадобится, то там подготовят и специальную версию – в течение 45 дней.

Что «омикрон» уже сделал с миром

Россия, Великобритания, Германия и Чехия, как и еще несколько стран временно запретили въезжать гражданам 6 южноафриканских стран, в том числе и из ЮАР. Израиль даже прекратил с ними авиасообщение. Также там разрешили отслеживать мобильные телефоны тех людей, которые заражены «омикроном».

В остальном все меры – прежние: все должны носить маски, соблюдать соцдистанцию, а также – личную гигиену. Власти призывают активнее вакцинироваться и ревакцинироваться.

В Великобритании стали усиливать ограничения в школах, так как именно среди детей вирус особенно активно распространяется. Теперь требование надевать маски за пределами своих классов распространяется на всех детей старше семи лет.

Что делают в ЮАР для сдерживания нового штамма

Ученые, открывшие «омикрон» у себя в стране, тут же подверглись критике за слишком стремительное обнародование данных. Как сообщает Mail&Guardian, в мире из-за этого все перепугались и отказались от полетов в Африку, а это больно ударило по экономике. Президент ЮАР Сирил Рамафоса сильно раскритиковал подобное решение и стал призывать не препятствовать туризму.

– Его выступление адекватно отражает сложившуюся ситуацию, – рассказал биолог Алексей Оскольский, преподаватель кафедры ботаники и биотехнологии растений Университета Йоханнесбурга. – О вирусе очень мало чего известно, поэтому паниковать из-за каждого нового штамма, лично мне кажется избыточным.

Рамафоса в обращении к нации попросил людей активнее прививаться. Он заявил, что никакого недостатка в препаратах нет, но вакцинировалось менее трети населения.

Оскольский это никак не связывает с антипрививочными настроениями.

– Среди тех, с кем лично я общаюсь, противников вакцинации нет, – заверил он. – К тому же – вакцина бесплатная. Все мои знакомые – привиты. Люди собираются в очереди на пунктах вакцинации.

Речь о локдауне в ЮАР сейчас не идет. Как сообщил профессор Мади, такие жесткие категоричные меры нужно осуществлять очень точечно, так как нельзя допустить коллапса системы здравоохранения. Тех ограничений, которые есть, пока достаточно.

А вот эпидемиолог Игорь Гундаров прокомментировал слова Александра Гинцбурга о быстром создании вакцины против «омикрон»-штамма. Он уточнил, что такая спешка вряд ли может быть оправдана.