Как появился «русский вариант» коронавируса

Рекомбинация вирусов

Гибридные, или, как выражаются биологи, рекомбинантные вирусы образуются, когда в одну клетку-хозяина попадают одновременно два разных штамма патогена. При репликации вирусное потомство с большой долей вероятности получит гены обоих «родителей».

На молекулярном уровне это выглядит следующим образом: фермент, который синтезирует РНК, копирует ее при репликации не целиком, а кусочками. К тому же он склонен переключаться с одной матрицы на другую. Если в клетке находятся сразу несколько близкородственных вирусных геномов, фермент может сбиться и сшить в единую цепочку части разных РНК.

Возникновение рекомбинантных вариантов — это естественное явление, которое распространено среди РНК-вирусов, а SARS-CoV-2 относится именно к ним. Некоторые ученые полагают, что и сам он образовался в результате смешения нескольких зоонозных патогенов. Его нуклеокапсид, то есть «тело» патогена, в котором находится свернутая РНК, такой же, как у коронавирусов, переносчиками которых являются летучие мыши. А у рецептор-связывающего домена — части шипа, непосредственно взаимодействующего с рецептором ACE2 при попадании в человеческую клетку, есть фрагменты, которые характерны для коронавирусов панголинов. Поэтому неудивительно, что при переходе на человека, коронавирус SARS-CoV-2 продолжил мутировать.

Из семейства «дельтакронов»

Рекомбинация — еще один, наряду с мутагенезом, механизм эволюции вирусов. Гибриды меняют патоген гораздо быстрее, чем постепенное накопление мутаций. Ученые выявили десятки рекомбинантных вариантов SARS-CoV-2.

О первом таком гибриде — «дельтакроне» — стало известно 8 января 2022 года. О нем сообщил профессор молекулярной вирусологии Университета Кипра Леонтиос Костриккис. По его словам, в 25 образцах биоматериала, которые взяли у 11 госпитализированных и 14 амбулаторных пациентов с коронавирусом, выявили COVID-19 с мутациями дельта- и омикрон-штамма. Однако позже эта информация не подтвердилась. Было установлено, что смешение — результат загрязнения проб.

При этом о возможности гибридных форм говорили с самого начала пандемии коронавируса. Так, в феврале этого года профессор кафедры вирусологии биологического факультета МГУ Алексей Аграновский в комментарии радио Sputnik заявил, что штаммы «омикрон» и «дельта» в одном месте — это очень плохой «коктейль». Из этих штаммов может что-то новое получиться. Чем больше людей в популяции болеют, тем выше вероятность этого события.

В начале июля вирусологи из Института гриппа им. Смородинцева в Санкт-Петербурге зафиксировали первый в России гибрид «омикрона» и «дельты». В отличие от кипрского, он реален. В его генетической последовательности начало и конец — от «дельты», а середина и спайковый белок — от «омикрона».

Новый вариант уже неофициально называют «русским дельтакроном». Ученые считают, что он действительно возник в нашей стране, потому что больше его пока нигде не выявили. На сегодняшний день гибрид подтвержден в 6-ти образцах, 5 из которых поступили из Петербурга и один — из Москвы.

Особенности «русского дельтакрона»

Структура спайкового белка, от которого зависит проникновение в клетки, у этого варианта почти такая же, как у «омикрона». Поэтому эксперты говорят, что он этот вариант больше похож именно на «омикрон», то есть высокотрансмиссивный, но не такой патогенным, как «дельта»-штамм.

На самом деле, все зараженные «дельтакроном» перенесли заболевание в легкой форме. Госпитализация не потребовалась, а симптомы не отличались от обычного «омикрона» — головная боль, осиплость, сухой кашель, а также чихание, слабость, небольшая температура и расстройство пищеварения.

При этом исследователи не торопятся с окончательными выводами. Все-таки у «дельтакрона» есть часть и от «дельта»-штамма — рекордсмена по тяжелым случаям.

В любом случае по словам ученых, этот гибрид вряд ли получит в России широкое распространение.

Ранее ученые заявили, что рынок в китайском городе Ухань стал эпицентром распространения коронавируса. Этот вирус начал распространяться среди людей после 2-х независимых друг от друга передач заболевания от животных к человеку. При чем первая передача произошла в период с 23 октября по 8 декабря 2019 года, а вторая – через нескольких недель после первой.