Создана программа для поиска родственных связей между животными

Виды отличаются друг от друга не только набором генов, но и их расположением.

Создана программа для поиска родственных связей между животными
Фото: © Pixabay.com
Москва, 16 июн 2020. /LIVE24/. Российские ученые из Университета ИТМО совместно с коллегами из США создали программу, при помощи которой можно быстро и эффективно найти похожие участки в геномах разных животных. Такой способ позволит понять, насколько два вида зверей близки друг к другу.

За Земле проживают миллионы разных биологических видов. Их разнообразие обусловлено генетическим уровнем. Одна вариативность самих генов гораздо меньше. Специалистам удалось выявить чуть более 20 тысяч на миллионы организмов. Это означает, что виды способны отличаться друг от друга не только по набору генов, но и по тому, как они расположены. Научным языком это явление называется синтения — порядок расположение генов и других элементов.

«Возьмем, к примеру, гориллу и шимпанзе. Эти два вида имеют одинаковый набор генов, но элементы их регуляции и перестройки генома создают немного разный порядок, что приводит к отличиям между этими приматами», — рассказывает первый автор статьи Ксения Крашенинникова, инженер-исследователь из Лаборатории компьютерных технологий ИТМО.


Разработка специалистов научно-образовательного центра Геномного разнообразия Университета ИТМО называется halSynteny. По словам ученых, она способна быстро искать синтенные блоки, что увеличивает точность исследований. Крашенинникова отметила, что основной целью разработки было написание алгоритма, который можно было бы легко применить к доступным данным.

«Мы используем метод выравнивания, то есть разные участки одного генома сопоставляются по степени похожести с участками другого генома. Таким образом мы можем выделить гомологичные участки, то есть обладающие одним и тем же происхождением», — рассказала ученый.


Первая проверка устройства уже прошла с участием кошек и собак. halSynteny отыскала их гены и сравнила друг с другом. Выяснилось, что некоторые хромосомы кошек объединяются в синтенные блоки с хромосомами собак. Это означает, что произошли они от генов их общего предка. Основываясь на таких результатах, можно строить новую теорию эволюции, а также проверять ее и использовать настоящую доказательную базу.

Ранее LIVE24 сообщало о раскрытой загадке пульсаров. Ученые продолжают изучение космических пространств.
0 0